โคนมเป็นสัตว์ที่ค่อนข้างง่ายต่อการติดโรค เมื่อมีโคป่วยตายด้วยโรคอันน่าสงสัยว่าเป็นโรคระบาดหรือเป็นอันตรายต่อสิ่งมีชีวิต ควรแจ้งแก่เจ้าหน้าที่ท้องถิ่นและเมื่อจำเป็นต้องทำลายซาก เกษตรกรก็ควรกระทำโดยเคร่งครัด
การทำลายซากโคทำได้ 2 วิธี คือ
1. การเผาซาก เนื่องจากโคมีขนาดใหญ่ต้องใช้เชื้อเพลิงมาก จึงไม่สะดวกนัก ควรขุดเป็นหลุมหรือร่องลึกประมาณครึ่งเมตรต่อโคหนึ่งตัวใช้ไม้ฟืนวางซ้อนกัน แล้วเอาซากสัตว์วางไว้ข้างบน แล้วจึงเผา การเผาอาจใช้น้ำมันเชื้อเพลิงหรือยางรถยนต์เก่า ๆ ช่วยด้วยก็ได้ การกำจัดซากแบบนี้เป็นวิธีที่ดีมาก
2. การฝังซาก ควรเลือกที่ห่างจากแหล่งน้ำ เพื่อป้องกันการกระจายเชื้อโรค ขุดหลุมกว้างและยาวพอเหมาะกับซาก ลึกประมาณสองเมตรครึ่งรองก้นหลุมด้วยปูนขาวก่อนนำซากโคลงและโรยปูนขาวทับซากอีกครั้งก่อนกลบซาก ดินที่กลบซากควรสูงกว่าหนึ่งเมตรครึ่ง และควรกั้นหรือทำสิ่งกีดขวางบริเวณที่ฝังซากป้องกันสัตว์อื่นขุดคุ้ย
ในการกำจัดซากโคนั้น ให้พยายามกำจัดเลือดและสิ่งขับถ่ายอื่น ๆ เท่าที่จะทำได้ด้วย หากมีการตกค้างอยู่ก็ควรทำลายเชื้อโรคด้วยน้ำยาฆ่าเชื้อ โดยเฉพาะอย่างยิ่งบริเวณคอกสัตว์ และควรพักคอกไว้ระยะหนึ่งก่อนนำสัตว์เข้ามาเลี้ยง